El Herbario Forestal cuenta a febrero de 2016 con una colección de 33.615 ejemplares botánicos representativos de todos los ecosistemas existentes en el país, que incluyen aproximadamente 6389 especies pertenecientes a 1797 géneros de 258 familias botánicas. El Herbario cuenta además con una colección de frutos y semillas de especies arbóreas representativas de la flora de Colombia, así como también una biblioteca especializada en Florística, Dendrología y Taxonomía. La colección está organizada bajo el sistema de clasificación de APG (2009).